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Laboratory Medicine

TO - Toxikologie & Arzneistoffanalytik

Pharmacogenetics and tumor treatment

Abacavir-Hypersensitivitätsreaktion

OMIM

142830

Gensymbole

HLA-B

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

Nachweis des HLA-Allels B*57:01 über PCR-SSP

Medikamentöse Relevanz

Abacavir-Hypersensitivitätsreaktion

Indication

V.a. Abacavir-Hypersensitivitätsreaktion bei Fieber, Hautausschlag, gastrointestinalen Beschwerden und/oder allgemeiner Abgeschlagenheit

Note

Für diese Untersuchung ist eine Einverständniserklärung der Patienten gemäß Gendiagnostikgesetz erforderlich.

Accredited

yes

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Androgen receptor (DHTR)

OMIM

313700

Gensymbole

AR

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

Testosterontherapie

Indication

Klinefelter-Syndrom, hypogonadale Männer

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ATP-bindende KASSETTE C2 (ABC Transporter C2, MRP2)

OMIM

601107

Gensymbole

ABCC2

Material

EDTA-Blut: 2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung
Auftragsspezifikation entsprechend Medikamentenangabe

Medikamentöse Relevanz

Tamoxifen

Indication

zusätzlich zu CYP2D6 und CYP2C19 bei Tamoxifentherapie eines Mammakarzinoms

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BRAF Mutationsanalyse (V600E)

OMIM

164757

Gensymbol

BRAF

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial (Paraffinmaterial) in 1,5 ml Eppendorf-Cup oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR und Sequenzierung von Exon 15

Indication
  • Anti-EGFR-Therapie eines Karzinoms vom kolorektalen Typ
  • Hyperplastische Polyposis
  • BRAF-Kinasehemmertherapie bei Melanom
  • nicht-kleinzelliges Bronchial-Ca vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie
  • RAF-Kinasehemmertherapie bei papillärem Schilddrüsenkarzinom
  • V.a. HNPCC

Siehe auch Molekulargenetik, Analysen A-Z/ RASopathien.
BRAF bei hämatologischen Neoplasien siehe Molekulargenetik, Analysen A-Z/ Haarzellleukämie.

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Butyrylcholinesterase deficiency / BCHE

OMIM

177400

Gensymbole

BCHE

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Sequenzierung aller 4 Exons

Medikamentöse Relevanz

Muskelrelaxantien wie z.B. Succinylcholin, Vecuronium, Pancuronium

Indication

Erniedrigte Cholinesterase-Aktivität, verringerte Dibucain- bzw. Fluoridzahl, verlängerte neuromuskuläre Blockade bzw. Apnoe nach Gabe von Muskelrelaxantien wie z.B. Succinylcholin, Vecuronium, Pancuronium.

Accredited

yes

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Carboxylesterase 1 deficiency

OMIM

114835

Gensymbole

CES1

Material

EDTA-Blut: 2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung
Auftragsspezifikation entsprechend Medikamentenangabe

Medikamentöse Relevanz

Oseltamivir, Methylphenidat

Indication

Tamiflu (Oseltamivir als Prodrug) vor Gabe, Verringerung des Risikos einer Resistenzentwicklung,
Methylphenidat (z.B. Ritalin, erhöhte Nebenwirkungen)

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Catechol-O-methyltransferase

OMIM

116790

Gensymbole

COMT

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

Opiate

Indication

V.a. gesteigerte Schmerzsensibilität, Opiattherapie

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Coumarin resistance

OMIM

122700
VKORC1: 608547, CYP4F2: 604426

Gensymbole

VKORC1 und CYP4F2

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung
Analysiert wird der Vitamin-K-Epoxidreduktasekomplex Untereinheit 1-Gen und CYP4F2*3.

Medikamentöse Relevanz

Cumarin-Derivate: Phenprocoumon, Warfarin, Acenocoumarol

Indication

Keine Wirkung von Cumarin-Präparaten bei Hochdosierung.

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Cumarin sensitivity

Gensymbole

VKORC1, CYP2C9 (PROC, EPHX1, GGCX, ORM1 auf Anfrage)

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

Cumarin-Derivate: Phenprocoumon, Warfarin, Acenocoumarol

Indication

Dosierung Cumarin-Derivate

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Cytochromes P 450 (overview)

Gensymbole

CYP1A2, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E1, CYP3A5, CYP4F2, CYP19A1

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung
Auftragsspezifikation durch Medikamentenangabe

Indication

Diskrepanz Medikamentendosierung und Serumspiegel, fehlende Medikamentenwirkung, unerwartete Nebenwirkungen (UAW), Dosisanpassungen

Note

Siehe auch Toxikologie/Arzneistoffe, Chemikalien A-Z mit molekularmedizinischem Hintergrund oder
Einzeleinträge:
CYP1A2
CYP2B6
CYP2C8
CYP2C9
CYP2C19
CYP2D6
CYP2E1
CYP3A5
CYP4F2
CYP19A1

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Dihydropyrimidin-Dehydrogenase (DPD), 5-Fluoruracil-Toxizität

OMIM

274270

Gensymbole

DPYD

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

Sequenzierung klinisch relevanter Genbereiche (E11,13,14,22 von DPYD), 4 klinisch relevante Genvarianten von DPYD gemäß EMA / DGHO:

Exon

CPIC
Allel*

Trivialname

HGVS

dbSNP

CPIC
Activity value

14

*2A

Exon 14-skipping

c.1905+1G>A
splice

rs3918290

0

13

*13

 

c.1679T>G,
p.I560S

rs55886062

0

22

_ _

 

c.2846A>T, p.D949V

rs67376798

0,5

11

c.1129-5923C>G,  c.1236G>A

Haplotyp B3 (HapB3)

c.1236G>A_ c.1129-5923C>G

rs56038477, Surrogat für Haplotyp B3 (E412E,gekoppelt)

0,5

Kostenhinweis

ab 1.10.2020 auch EBM: 1x GOP 32867, 1x GOP 11301

Medikamentöse Relevanz

5-Fluoruracil (5-FU) -haltige Therapien

Die EMA8 empfiehlt: Patient*innen vor Beginn der Behandlung mit Fluorouracil (als Injektion oder Infusion), Capecitabin, Tegafur auf DPD-Mangel zu testen.

Indication

Gemäß aktuellen Rote-Hand-Briefen sowie dem Positionspapier der DGHO vom Juni 2020 und aktuellen Empfehlungen von EMA8 einschließlich des BfArM7/Fachinformationen der Arzneimittelhersteller sollen Patient*innen vor Initiierung einer Therapie mit 5-FU (z.B. auch aus Prodrug Capecitabine) genetisch auf Vorliegen klinisch relevanter Genvarianten von DPYD getestet werden. Alternativ kann ein Phenotyping erfolgen, wobei in Deutschland bisher weder die Bestimmung der DPD-Aktivität aus pB, noch die Uracil-Bestimmung oder die Bestimmung der ratio Dihydrouracil/Uracil (jeweils aus Plasma) zum Standardportfolio in der Labormedizin gehören und auch prospektiv validierte Daten klinischer Studien fehlen. Bei sehr spärlicher Datenlage ist aktuell die Genetik weiterhin als Goldstandard zu betrachten, wenngleich laut EMA oder DGHO bereits die Uracil-Messung als weitere Möglichkeit genannt wird.

Bei Vorliegen eines Genotyps mit poor oder intermediate metabolizer-Allelen sind Handlungsempfehlungen zur Dosisreduktion/-findung publiziert, die das Auftreten von Toxizitätsevents minimieren.1-8

Hinweis: Die Uracil-Bestimmung wird in unserem Labor in Kürze etabliert (Stand: 18.06.2020).

Auch bei Anzeichen einer Intoxikation (z.B. Neutropenie) nach Chemotherapie mit 5-Fluoruracil (5-FU) kann noch eine entsprechende genetische Testung erfolgen, ggfs. bis hin zur Komplettsequenzierung von DPYD und Deletionssuche mit MLPA.
 

  1. Henricks et al., Lancet Oncol. 2018 Nov;19(11):1459-1467. doi: 10.1016/S1470-2045(18)30686-7. Epub 2018 Oct 19.
  2. https://www.pharmgkb.org
  3. CPIC online https://cpicpgx.org/guidelines/guideline-for-fluoropyrimidines-and-dpyd/ und hier updates von DPYD allele functionality table and DPYD genotype-phenotype table, vgl. auch Amstutz U, Henricks LM, Offer SM et al.: Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for Dihydropyrimidine Dehydrogenase Genotype and Fluoropyrimidine Dosing: 2017 Update. Clin Pharmacol Ther 103:210-216, 2018. DOI: 10.1002/cpt.911
  4. Französische guidelines Loriot MA, Ciccolini J, Thomas F, Barin-Le-Guellec C, Royer B, Milano G. et al. Dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD) deficiency screening and securing of fluoropyrimidinebased chemotherapies: update and recommendations of the French GPCO-Unicancer and RNPGx networks. Bull Cancer. 2018;105:397–407.
  5. Holländische guidelines Lunenburg ATC, van der Wouden CH, Nijenhuis M et al.: Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) Guideline for the Gene-Drug Interaction of DPYD and Fluoropyrimidines. Eur J Hum Genet 28:508-517, 2020. DOI: 10.1038/s41431-019-0540-0
  6. 6 zusammengefasst im DGHO Positionspapier vom Juni 2020 zur DPD Testung, Prof. Wörmann et al.
  7.  https://www.bfarm.de/SharedDocs/Risikoinformationen/Pharmakovigilanz/DE/RV_STP/a-f/fluorouracil-neu.html
  8.  https://www.ema.europa.eu/en/documents/referral/fluorouracil-fluorouracil-related-substances-article-31-referral-ema-recommendations-dpd-testing_en.pdf
  9. Meulendijks D, Hendricks LM, Jacobs BAW et al.: Pretreatment Serum Uracil Concentration as a Predictor of Severe and Fatal Fluoropyrimidine-Associated Toxicity. Br J Cancer 116:1415-1424, 2017. DOI: 0.1038/bjc.2017.94
Note

Weitere Informationen zum Thema DPD-Mangel siehe auch LabmedLetter Nr. 134

Bei der molekulargenetischen Testung auf DPYD-Varianten handelt es sich um eine diagnostische Untersuchung im Sinne von § 3 Nr. 7 c des Gendiagnostikgesetzes (GenDG), die einer ärztlichen Aufklärung und einer Einwilligung der/des Patient*in bedarf.

Accredited

yes

DPYD E14-skipping und ergänzende Methode NGS (Next Generation Sequencing) / nextera amplicon technique, Sequencing by Synthesis (MiSeq & NextSeq, Illumina)

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EGFR Mutationsanalyse bei nicht-kleinzelligem Bronchial-Ca

OMIM

131550

Gensymbol

EGFR

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial (Paraffinmaterial) in 1,5 ml Eppendorf-Cup oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR und Sequenzierung (Exon 18-21, auf Wunsch auch Exon 22-24)

Medikamentöse Relevanz

Tyrosinkinasehemmer-Therapie z.B. bei Gefitinib

Indication

nicht-kleinzelliges Lungenkarzinom / NSCLC

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ETV6-PDGFRB fusion gene

OMIM

600618, 173410

Gensymbole

ETV6-PDGFRB

Material

EDTA-Blut: 10 ml
EDTA-Knochenmark: 2-5 ml

Methode

Nested RT-PCR ETV6-PDGFRB Transkripte
Vorzugsweise FISH-Analytik durchführen.

Medikamentöse Relevanz

Tyrosinkinaseinhibitoren wie Imatinib, Dasatinib, Nilotinib.
Auch für andere bei CMML bekannte Chromosomenaberrationen werden Therapieerfolge mit Kinaseinhibitoren wie Imatinib (Glivec) berichtet.

Indication

CMML mit Eosinophilie, Abklärung nicht reaktiver Eosinophilien, aCML, CEL, MPN, mit Eosinophilie, selten AML. CMML mit t(5;12)(q33;p13) zeigen meist Eosinophilie. Etwa 2-10% aller CMML sind positiv für die t(5;12)(q33;p13).
Etwa 50% aller PDGFRB Rearrangements entfallen auf die t(5;12)(q33;p13).
Vorzugsweise FISH-Analytik durchführen. Vgl. Eintrag Eosinophilie.

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FIP1L1/PDGFRA fusion gene (microdeletion 4q12)

OMIM

607686, 173490

Gensymbole

FIP1L1, PDGFRA

Material

EDTA-Blut: 10 ml,
EDTA-Knochenmark: 2-5 ml

Methode

Nested RT-PCR FIP1L1-PDGFRA Transkripte und DNA PCR der Bruchpunktregion.
Vorzugsweise FISH-Analytik durchführen. (Die Mikrodeletion 4q12 ist zytogenetisch kryptisch und lässt sich daher nur mittels PCR und/oder FISH zeigen.)

Medikamentöse Relevanz

Tyrosinkinaseinhibitoren wie Imatinib, Dasatinib, Nilotinib.

Indication

V.a. CEL, AML oder TLBL mit Eosinophilie, Abklärung nicht reaktiver Eosinophilien.
Vgl. Eintrag Eosinophilie.

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Gilbert syndrome / Meulengracht disease

OMIM

143500

Gensymbole

UGT1A1

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Schmelzpunktanalyse der TA-repeats im UGT1A1-Promotor (Lightcycler), erweiterte Mutationssuche möglich (klinische Sensitivität für M.M. ca. 80%, falls gewünscht, Sequenzierung restliche Exons möglich)
Siehe auch Crigler-Najjar-Syndrom.

Medikamentöse Relevanz

Didanosin, Irinotecan (CPT11), Lamivudin, Lamotrigin, Nevirapin, Paracetamol, Stavudin

Indication

Zur Differentialdiagnose erblicher Formen einer Hyperbilirubinämie, insbesondere bei verlängerter Neugeborenenhyperbilirubinämie: ABO inkompatible bzw. G6PDH-defiziente Neugeborene (nicht jedoch Normalpersonen!) mit Morbus Meulengracht haben ein erhöhtes Risiko eines Kernikterus.
Irinotecan (CPT11)-Verträglichkeit, verminderte Eliminierung von Irinotecan bei UGT1A1*28 6/7 und 7/7.

Accredited

yes

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Glucose-6-phosphate-dehydrogenase deficiency (acute hemolytic anaemia)

OMIM

305900

Gensymbole

G6PD

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Sequenzierung der kodierenden Exons 2-13

Medikamentöse Relevanz

Acetazolamid, Co-Trimoxazol, Dapson, Metamizol, Naphtalin, Nitrofurantoin, Sulfacetamid, u.a.

Indication

Angeborene, nicht-sphärozytäre, hämolytische Anämien, auch durch Medikamentenunverträglichkeit oder Infektionen hervorgerufene, akut auftretende hämolytische Krisen, z.T. auch chronisch, X-chromosomal erblich, Konduktorinnenstatus am sichersten über Genanalyse zu erfassen.

Note

siehe auch Pyruvat-Kinase

Accredited

yes

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Glutathione S-transferase (M1, P1, T1)

OMIM

138350, 134660, 600436

Gensymbole

GSTM1, GSTP1, GSTT1

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung

Indication

Intoxikation, unerwartete Nebenwirkungen nach Medikamentengabe, verstärkte Reaktion bei Umweltgiften, Genotypen mit reduziertem Detoxifikationspotential

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IL28B-Polymorphism (rs12979860)

OMIM

609532

Gensymbole

IFNL3 (ehemals IL28B, 607402)

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Sequenzierung

Medikamentöse Relevanz

Ansprechen auf eine Kombinationstherapie mit PEG-Interferon alpha und Ribavirin.

Indication

Patienten mit Hepatitis HCV Genotyp 1 und homozygotem Genotyp C/C haben im Vergleich zu Patienten mit den Genotypen C/T und T/T eine signifikant höhere Chance, das Virus spontan zu eliminieren (Ausheilung) und ein dauerhaftes Ansprechen (sustained virologic response, SVR) auf eine Kombinationstherapie mit PEG-Interferon alpha und Ribavirin zu erreichen. Siehe auch ITPA-Polymorphismen rs1127354 und rs7270101.

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Irinotecan-intolerance

OMIM

606432: UGT1A7
191740: UGT1A1

Gensymbole

UGT1A1 und UGT1A7

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

UGT1A1: PCR und Schmelzpunktanalyse der TA-repeats im UGT1A1-Promotor (Lightcycler), UGT1A7: PCR und Sequenzierung Exon 1 und Promotor

Medikamentöse Relevanz

Irinotecan

Indication

Irinotecan (CPT11)-Verträglichkeit, verminderte Eliminierung von Irinotecan bei UGT1A1*28 6/7 und 7/7 und UGT1A7 Homozygot c.1-57 C>G, homozygot Codon 129Lys, homozygot Codon 131Lys (high risk!)
Siehe auch Meulengracht, Morbus.

Note

Weitere Informationen siehe unser Informationsblatt Polymorphe SNP´s in UGT1A7 und UGT1A1 und Risiko einer Irinotecantherapie.

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ITPA-Polymorphisms (rs1127354 and rs7270101)

OMIM

613850

Gensymbole

ITPA (147520)

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Sequenzierung

Medikamentöse Relevanz

Kombinationstherapie mit PEG-Interferon alpha und Ribavirin bei Infektion mit HCV.

Indication

Die jeweils selteneren Allele ("minor alleles") von rs1127354 (= A) und rs7270101 (= C) sind mit einer verminderten Aktivität bzw. Defizienz der Inosin-Triphosphatase (ITPase) assoziiert und gehen mit einem geringeren Risiko für eine Ribavirin-induzierte hämolytische Anämie einher. Siehe auch IL28B-Polymorphismus rs12979860.

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KIT Mutationen bei Gastrointestinalen Stromatumoren (GIST)

OMIM

164920

Gensymbol

KIT

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial (Paraffinmaterial) in 1,5 ml Eppendorf-Cup oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR, Sequenzierung der Exons 9, 11, 13 und 17
Stufendiagnostik: 1. KIT, 2. PDGFRA

Medikamentöse Relevanz

Imatinib, Dasatinib, Nilotinib, Sunitinib, Sorafenib

Indication
  • vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie des chemotherapierefraktären oder metastasierten Karzinoms, empfehlenswert für alle neu diagnostizierten Hochrisiko oder malignen GIST, Vorhersage des Therapieerfolgs von Imatinib, prognostische Relevanz
  • Detektion sekundärer Resistenzen unter Tyrosinkinaseinhibition
  • familiär gehäufte Fälle (meist multiple GIST); siehe KIT Mutationen bei hereditärem GIST, PDGFRA Mutationen bei hereditärem GIST (hierfür EDTA-Blut erforderlich)
  • KIT Mutationen bei AML, siehe separater Eintrag in Molekulargenetische Analysen A-Z
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KRAS Mutationsanalyse

OMIM

190070

Gensymbol

KRAS

Material

2 x 5 Paraffinschnitte in 1,5 ml Eppendorf-Cups oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR, Sequenzierung, Realtime-PCR
K-RAS Mutationen in Exon 2-4 speziell Codon 12, 13, 61, 117 und 146

Medikamentöse Relevanz

Cetuximab, Matuzumab, Panitumumab

Indication
  • Anti-EGFR-Therapie eines Karzinoms vom kolorektalen Typ oder dessen Metastasen
  • Hyperplastische Polyposis
  • nicht-kleinzelliges Bronchial-Ca vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie
  • BRAF-Kinasehemmertherapie bei papillärem Schilddrüsenkarzinom

KRAS auch bei kolorektalem Karzinom; erbliche Erkrankungen siehe auch RASopathien und hämatologische Neoplasien.

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Molekularpathologische Untersuchung der Methylierung der Promotorbereiche der Reparaturenzym-Gene MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MGMT und PMS2 bei Verdacht auf HNPCC / Lynch-Syndrom

OMIM

276300

Material

Mikrodissektiertes Tumormaterial sowie tumorfreies Gewebe jeweils in 1,5 ml Eppendorf-Cups, alternativ zum tumorfreien Gewebe: 2 ml EDTA-Blut

Methode

Methylierungsspezifische MLPA zur Detektion des Promotor-Methylierungsstatus von MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MGMT und PMS2

Indication

Das dominant erbliche hereditäre non-polypöse Kolonkarzinom (HNPCC), auch Lynch-Syndrom genannt, basiert auf einer inaktivierenden Keimbahnmutation in einem der DNA-Mismatch-Repair-(MMR-) Gene. Die Enzyme der MMR-Gene (MLH1, MSH2, MGMT, PMS2, MSH3 und MLH3) reparieren während der DNA-Replikation entstandene Basenfehlpaarungen in der DNA und erhalten somit die Integrität des Genoms. Ist dieser Mechanismus gestört, akkumulieren genomweit Mutationen. Kolorektale Tumore von Patienten mit Lynch-Syndrom zeigen keine oder selten eine sehr schwache Methylierung des Promotorbereichs von MLH1. Der Nachweis einer Methylierung im Tumor ist daher eher ein Hinweis auf ein sporadisches Geschehen als auf HNPCC.

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MSI - Mikrosatelliteninstabilität eines kolorektalen Karzinoms

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial sowie tumorfreies Gewebe jeweils in 1,5 ml Eppendorf-Cups,
alternativ zum tumorfreien Gewebe: 2 ml EDTA-Blut

Methode

PCR und Fragmentlängenanalyse der Marker: BAT25, BAT26, D5S346, D2S123 und D17S250; weitere auf Anfrage möglich.

Indication

V.a. HNPCC, kolorektales Karzinom: Prognosefaktor zusätzlich bei 5-FU-Therapie

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MTHFR (5,10-Methylenetetrahydrofolate reductase deficiency)

OMIM

188050

Gensymbole

MTHFR (607093)

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Schmelzpunktanalyse (Lightcycler) der Nukleotide 677 und 1298

Indication

Hyperhomocysteinämie als atherogenes Risiko, Risikofaktor für arterielle und venöse Gefäßverschlüsse,
Methotrexat-Unverträglichkeit

Accredited

yes

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Multidrug resistance protein 1

OMIM

171050

Gensymbole

MDR1/ABCB1/PGP

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

Digoxin, Protease-Inhibitoren (HIV-Medikamente), Antibiotika (z.B. Cephazolin), Calcium-Antagonisten (z.B. Verapamil), Immunsuppressiva (z.B. Cyclosporin)

Indication

Diskrepanz Medikamentendosierung und -wirkung, unerwartete Nebenwirkungen (UAW), Dosisanpassungen

Note

Ca. 25% slow transporter

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N-Acetyltransferase 1

OMIM

108345

Gensymbole

NAT1

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

z.B. Sulfamethoxazol

Indication

Acetyliererstatus (in Verbindung mit NAT2): verstärkte Reaktionen gegenüber Umweltgiften

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N-Acetyltransferase 2 (Acetylation, slow)

OMIM

243400

Gensymbole

NAT2

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

Coffein, Dapson, Dihydralazin, Hydralazin, Isoniazid, Procainamid, Sulfamethoxazol

Indication

Diskrepanz Medikamentendosierung und Serumspiegel, fehlende Medikamentenwirkung,
unerwartete Nebenwirkungen (UAW), Dosisanpassungen, Acetyliererstatus (in Verbindung mit NAT1): verstärkte Reaktionen gegenüber Umweltgiften

Note

40-50% PM, slow Acetylierer

Accredited

yes

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NAD(P)H: Chinonoxidoteductase-1 (NQO1) *2 (609C>T)

OMIM

125860

Gensymbole

NQO1

Material

EDTA-Blut: 2-4 ml

Methode

PCR und Sequenzierung

Indication

Allel *2 und *3 mit reduzierter Aktivität von NAD(P)H: Chinonoxidoreduktase-1 assoziiert, erhöhtes Risiko bei Benzol-Exposition für eine Vergiftung, Prädisposition für Burkitt-Lymphom

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E-Mail: abeckmann@labmed.de

NRAS Mutationsanalyse

OMIM

164790

Gensymbol

NRAS

Material

2 x 5 Paraffinschnitte in 1,5 ml Eppendorf-Cups oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR, Sequenzierung, Realtime-PCR
NRAS Mutationen in Exon 2-4 speziell Codon 12, 13, 61, 117 und 146

Medikamentöse Relevanz

Cetuximab, Matuzumab, Panitumumab

Indication
  • Anti-EGFR-Therapie eines Karzinoms vom kolorektalen Typ oder dessen Metastasen
  • Hyperplastische Polyposis
  • nicht-kleinzelliges Bronchial-Ca vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie
  • BRAF-Kinasehemmertherapie bei papillärem Schilddrüsenkarzinom

NRAS auch bei kolorektalem Karzinom; 
erbliche Erkrankungen siehe auch RASopathien.

Accredited

yes

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Organic anion transporter 1B1

OMIM

604843

Gensymbole

SLCO1B1

Material

EDTA-Blut: 2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung
Auftragsspezifikation entsprechend Medikamentenangabe

Medikamentöse Relevanz

z.B. Simvastatin

Indication

bei Statin-Gabe (Simvastatin) erhöhte Nebenwirkungen, Myopathie

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Paraoxonase 1

OMIM

168820

Gensymbole

PON1

Material

EDTA-Blut: 2 ml

Methode

PCR, Genotypisierung
Auftragsspezifikation entsprechend Medikamentenangabe

Indication

Clopidogrel-Resistenz, V.a. Überreaktion bei Pestiziden, erhöhte Neigung zu Arteriosklerose

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PDGFRA Mutationen bei Gastrointestinalen Stromatumoren (GIST)

OMIM

173490

Gensymbol

PDGFRA

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial (Paraffinmaterial) in 1,5 ml Eppendorf-Cup oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR, Sequenzierung der Exons 12, 14 und 18
Stufendiagnostik: 1. KIT, 2. PDGFRA

Medikamentöse Relevanz

Imatinib, Dasatinib, Nilotinib, Sunitinib, Sorafenib

Indication
  • vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie eines chemotherapierefraktären oder metastasierten Karzinoms, empfehlenswert für alle neu diagnostizierten Hoch-Risiko oder malignen GIST, Vorhersage des Therapieerfolgs von Imatinib, prognostische Relevanz
  • Detektion sekundärer Resistenzen unter Tyrosinkinaseinhibition
  • familiär gehäufte Fälle (meist multiple GIST); siehe PDGFRA Mutationen bei hereditären GIST, KIT Mutationen bei hereditären GIST (hierfür EDTA Blut erforderlich)
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Phosphatidylinositol-3-Kinase (PIK3CA) Mutationsanalyse (Ex 11 und 22)

OMIM

171834

Gensymbol

PIK3CA

Material

mikrodissektiertes Tumormaterial (Paraffinmaterial) in 1,5 ml Eppendorf-Cup oder Paraffinblock des Tumors

Methode

PCR und Sequenzierung von Exon 11 und 22

Indication

Vor Therapiebeginn, zum Ausschluss einer durch aktivierende Mutationen im PIK3CA
möglicherweise verminderte Effizienz folgender Therapien:

  • Anti-EGFR-Therapie eines Karzinoms vom kolorektalen Typ
  • Nicht-kleinzelliges Bronchial-Ca vor Tyrosinkinasehemmer-Therapie
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Sulfotransferase 1A1

OMIM

171150

Gensymbole

SULT1A1

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

PCR und Genotypisierung

Medikamentöse Relevanz

z.B. Paracetamol

Indication

unerwartete Nebenwirkungen

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Superoxide dismutase 2 (rs4880)

OMIM

147460

Gensymbole

SOD2

Material

EDTA-Blut: 2-4 ml

Methode

PCR und Sequenzierung

Indication

reduzierte Aktivität von SOD2 in Leberzellen, erhöhter oxidativer Stress, erhöhtes Risiko für eine diabetische Nephropathie, erhöhtes Risiko für eine Mitochondriopathie

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Thiopurine S-methyltransferase deficiency

OMIM

187680

Gensymbole

TPMT

Material

EDTA-Blut: 1-2 ml

Methode

Stufendiagnostik: PCR und Sequenzierung der Exons 5,7 und 10.
Messung der Enzymaktivität aus gleicher Probe möglich.

Medikamentöse Relevanz

6-Mercaptopurin (z.B. bei Gabe von Azathioprin/ Imurek)
6-Thioguanin (Myelosuppression)

Indication

Eine TPMT-Defizienz führt zu einer schweren hämatopoetischen Toxizität nach Gabe von 6-Mercaptopurin (z.B. bei Gabe von Azathioprin) oder 6-Thioguanin (Myelosuppression). 6-Mercaptopurin oder 6-Thioguanin werden zur antineoplastischen Therapie eingesetzt, außerdem bei Autoimmunerkrankungen und Organtransplantationen.

Note

0,5% klinisch relevante TPMT-Defizienzen, ca. 11% heterozygote Genträger mit Indikation zur Dosisreduktion und/oder Therapiemonitoring

Accredited

yes

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Tel: +49 231 9572-6617
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House 1

Laboratoriumsmedizin, Humangenetik

Brauhausstraße 4
44137 Dortmund

Laboratoriumsmedizin Dortmund

Zugang Patient:inen für Blutentnahme, Probenabgabe, private Vorsorge, MPU, Reisemedizin

Humangenetische Sprechstunde

Dr. med. S. Schön
Dr. med. J. Kötting

House 2

Mikrobiologie, Infektions-PCR

Balkenstraße 17-19
44137 Dortmund

House 3

Analytik Laboratoriumsmedizin und Humangenetik

Probenannahme für Fahrdienst, Taxi, Paketdienste, Speditionen
Warenannahme (Rolltor links)
Kein Patientenverkehr!

Balkenstraße 12-14
44137 Dortmund

House 4 - Hansakontor

Endokrinologie, Diabetologie, Rheumatologie, Humangenetik, Schulungszentrum

Silberstraße 22 (Hansakontor)
44137 Dortmund

Zentrum für Endokrinologie, Diabetologie, Rheumatologie

Dr. med. F. Demtröder & Kollegen

Humangenetische Sprechstunde

Dr. med. Annemarie Schwan

Schulungszentrum des MVZ

Silberstraße 22
44137 Dortmund

House 5 - Triagon Dortmund

Hormon- und Stoffwechselzentrum für Kinder und Jugendliche

Triagon Dortmund
Alter Mühlenweg 3

44139 Dortmund

Hormonzentrum für Kinder und Jugendliche

Prof. Dr. med. Richter-Unruh & Kollegen

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